一、迷宫之困:未知感染,何处寻踪?
医院急诊室里,灯光亮得如同白昼一般。有患者一直高热不退,进行血培养都三日了 ,然而竟然没有一个细菌生长出来。医生皱起了眉头 ,患者家属忍不住流下泪来。这是临床上常常会出现的让人为难的境况 ,明明知道是感染了 ,可是不清楚到底是哪种细菌 ;就算有能对抗多种细菌的抗生素 ,这也跟盲人摸象没什么区别。
有这样一种说法,《黄帝内经》里面讲过,“上工治未病” ,然而呢,要是不知道疾病产生的根源,那又如何去进行治疗呢?
传统的法,依靠培养。然而天地之间的微生物,十分之九不能够培养。这是微生物学百年的“暗物质”。难道不让人感到惋惜吗?
二、破壁之术:宏基因组测序,直捣黄龙
提问:要是不进行培养,直接去提取样本里所有的DNA,然后再开展测序,这样能不能全部涵盖呢?
真乃此理啊!宏基因组测序也就是mNGS,它摒弃了培养的束缚,获取标本里所有微生物的遗传密码,举个例子来说,脑脊液只有0.5毫升,送去检验,不用预先判断是细菌、病毒,还是真菌、寄生虫,三十六小时之后,报告回来了,显示是单纯疱疹病毒1型,进行抗病毒治疗,三天后热度消退了。
此技之妙,在于无偏倚。
细菌?检出。
病毒?检出。
甚至罕见虫媒病原?亦检出。
于传统PCR进行对比,是需要预先设定目标的;于培养进行对比,是需要等候数周时光的。mNGS像那天道之网,极为广袤,稀疏之处却不会出现遗漏情况的。
三、辩证之思:利器亦有双刃
然而,天下岂有万全之法?
管理层当明辨:
其一,成本高昂。 单测序试剂,动辄数千。若泛用,医保难承。
其二,解读极其复杂,样本当中定植菌跟致病菌,究竟要怎样区分呢?呼吸道检测出肺炎链球菌,这到底是病源还是过客呢?
第三点,是来自人的干扰,人类作为宿主,其DNA所占比例超过99%,要是不进行微生物富集的话的情况呢,就如同在大海里捞取一根针那样困难,像这种情况呀。

存在着一种甚嚣尘上的对立观点:认为此项技术华而不实,不过是仍属于研究范畴的工具。然而事实是能够胜过雄辩的:在2020年的时候,《新英格兰医学杂志》发表了文章表述,mNGS对于脑膜炎的诊断,其敏感度达到了92%,这一数值要高于培养方式的35%。
四、未来已来:从精准诊断到主动监测
螺旋上升,方见真章。今日之mNGS,已非实验室之玩物。
应用层级,步步登高:
1. 危急重症 —— 不明原因发热、脓毒症、免疫缺陷患者感染。
2. 疑难杂症 —— 慢性腹泻、间质性肺炎、中枢神经系统感染。
3. 公共卫生 —— 新发传染病暴发,数小时锁定病原。
想象一下,在机场的口岸那里,有一滴咽拭子能够同时对三万种病原进行筛查,这可不是科幻内容,而是已经落地成为现实的技术了。
古老先哲老子曾言:“道生一,一生二,二生三,三生万物。”如今宏基因组测序这项技术,正从单一的样本出发,进而衍生出包含万物的病原谱。
五、余音袅袅:留白之处,更待何人?
傍晚时分,太阳渐渐西沉,实验室里荧光不断闪烁,自动化测序仪静静地运转着,数据流动的样子就如同江河奔腾流向大海般。
管理者立于决策之巅:
是否将mNGS纳入院内检测目录?
如何平衡成本与收益?
怎样培训临床医生解读报告?
在留白的地方,恰恰是你开始落笔的时候。天底下的武功,唯有速度快才能没有破绽;天底下的诊断,唯有全面细致才不会有遗漏。宏基因组测序,并非是无所不能的,然而却已经让游戏规则发生了改变。
诸君,且行且思。

